Księgowość dla lekarzy i branży medycznej

Księgowość dla lekarzy na kontrakcie, prywatnych praktyk i placówek medycznych – ryczałt 14% albo podatek liniowy, zwolnienie z VAT, faktury w KSeF i kilka umów rozliczanych jednocześnie. Wszystko u jednego dedykowanego księgowego.

Lekarze na kontrakcie Prywatne praktyki lekarskie Lekarze dentyści Fizjoterapeuci i psycholodzy Pielęgniarki i położne Przychodnie i centra medyczne

Biuro rachunkowe dla lekarzy

Dla kogo jest ta oferta?

Obsługa księgowa lekarzy i praktyk medycznych w każdej skali – od pierwszego kontraktu w szpitalu po przychodnię z umową z NFZ:

Lekarzy i stomatologów na kontrakcie w szpitalu lub przychodni

Lekarzy łączących etat z kontraktem i praktyką prywatną

Prywatnych gabinetów lekarskich i stomatologicznych

Fizjoterapeutów, psychologów, pielęgniarek i położnych

Przychodni, poradni i centrów medycznych z umowami z NFZ

Rezydentów kończących specjalizację i przechodzących na kontrakt

Szukasz księgowego, który wie, kiedy lekarz nie może przejść na ryczałt? Dedykowana księgowa dla branży medycznej, a nie ogólne biuro rachunkowe. Odpowiadamy w ciągu 1 dnia roboczego.

Napisz do nas →
Lekarz przy biurku czyta dokumenty na podkładce

Formy działalności

Rozliczamy różne modele pracy w ochronie zdrowia

Księgowość medyczna wygląda inaczej u lekarza z jednym kontraktem, inaczej w przychodni z umową z NFZ. Formę opodatkowania i zakres ewidencji dobieramy do tego, jak pracujesz.

Lekarz na kontrakcie

Ryczałt 14% albo podatek liniowy – porównane na Twoich realnych przychodach i kosztach. Do tego ZUS, składka zdrowotna i faktury dla szpitala w KSeF.

Prywatna praktyka

Pacjenci prywatni i kasa fiskalna online, koszty gabinetu i sprzętu, a przy usługach spoza leczenia także VAT. Rozdzielamy świadczenia zwolnione od opodatkowanych.

Etat i kontrakt jednocześnie

Przy kilku tytułach do ubezpieczeń ustalamy, od czego płacisz składki społeczne, a od czego tylko zdrowotną. Wszystkie przychody rozliczamy potem w zeznaniach rocznych.

Przychodnia i spółka medyczna

Pełne księgi, rozliczenia z NFZ, kontrakty lekarzy i personelu oraz sprzedaż zwolniona i opodatkowana VAT w jednej firmie – z proporcją odliczenia podatku.

Ryczałt dla lekarzy i zwolnienia z VAT

Pilnujemy stawki ryczałtu i granic zwolnienia z VAT

Ryczałt dla lekarzy to najczęstszy powód zmiany biura rachunkowego w branży medycznej. Sprawdzamy stawkę i to, czy przy Twoim kontrakcie ta forma jest w ogóle dostępna.

Ryczałt 14% za usługi medyczne

Stawka ryczałtu dla lekarzy przy usługach w zakresie opieki zdrowotnej wynosi 14%. Tak samo rozliczają się m.in. pielęgniarki, położne i fizjoterapeuci. Wykłady czy szkolenia mogą mieć inną stawkę.

Kontrakt u byłego pracodawcy

Jeśli na kontrakcie robisz to, co wcześniej na etacie u tego samego pracodawcy, nie możesz wybrać ryczałtu w roku zakończenia etatu ani w roku następnym. Dotyczy to zwłaszcza lekarzy po rezydenturze.

Nie każda usługa medyczna jest zwolniona z VAT

Leczenie i profilaktyka są zwolnione z VAT, ale medycyna estetyczna bez wskazań zdrowotnych czy część zaświadczeń już nie. Sprawdzamy każdą nową usługę w cenniku gabinetu.

KSeF i kasa fiskalna

Faktury dla szpitali i przychodni trafiają do KSeF także przy usługach zwolnionych z VAT. Lekarz przyjmujący pacjentów prywatnych potrzebuje kasy fiskalnej online od pierwszej wizyty.

Kończysz rezydenturę i przechodzisz na kontrakt? Sprawdzimy umowę i historię zatrudnienia, zanim zdecydujesz o formie opodatkowania – wybór obowiązuje przez cały rok.

Porozmawiajmy →

Cennik usług księgowych dla lekarzy

Pakiety dla lekarzy i placówek medycznych

Cena zależy od liczby dokumentów, formy prawnej i tego, czy przyjmujesz pacjentów prywatnych.

Cennik dla lekarzy na JDG

Wybierz pakiet dopasowany do liczby dokumentów i zakresu obsługi.

Basic

199 zł/mies. netto

do 10 dokumentów

  • KPiR lub ewidencja przychodów
  • Rozliczenie podatku dochodowego
  • Rozliczenie ZUS właściciela
  • Kontakt mailowy i telefoniczny
  • Faktury dla szpitali i przychodni w KSeF

Pro

499 zł/mies. netto

do 60 dokumentów

  • Wszystko z pakietu Standard
  • Roczny PIT z działalności
  • Kontakt priorytetowy
  • Wystawianie faktur sprzedaży w imieniu klienta – do 10 faktur/mies.
  • Praktyka prywatna i kasa fiskalna online

Premium

649 zł/mies. netto

do 120 dokumentów

  • Wszystko z pakietu Pro
  • Wystawianie faktur sprzedaży w imieniu klienta – do 15 faktur/mies.
  • Obsługa przy dużej liczbie dokumentów
  • Rozliczenie przychodów spoza leczenia

Cennik dla przychodni i spółek medycznych

Pełna księgowość i zakres wsparcia dopasowany do skali działalności.

Basic

999 zł/mies. netto

do 20 dokumentów

  • Księgi rachunkowe i ewidencja operacji
  • Rozliczenie CIT
  • Rozliczenie VAT i JPK_V7
  • Podstawowe podsumowanie miesięczne
  • Ewidencja przychodów z umów z NFZ

Pro

1 699 zł/mies. netto

do 100 dokumentów

  • Wszystko z pakietu Standard
  • Rozszerzone podsumowanie i wsparcie
  • Kontakt priorytetowy
  • Wystawianie faktur sprzedaży w imieniu klienta – do 20 faktur/mies.
  • Sprzedaż zwolniona i opodatkowana VAT

Premium

2 599 zł/mies. netto

do 150 dokumentów

  • Wszystko z pakietu Pro
  • Kontrola należności i zobowiązań
  • Podsumowanie z analizą
  • Wystawianie faktur sprzedaży w imieniu klienta – do 30 faktur/mies.
  • Analiza rentowności poradni i gabinetów

Kadry i usługi dodatkowe

Obsługa zatrudnienia i czynności wykraczające poza miesięczny abonament.

Kadry i płace

  • Umowa o pracę od 70 zł/os./mies. wynagrodzenie, ZUS, dokumentacja kadrowa
  • Umowa zlecenia lub o dzieło od 50 zł/os./mies. rachunek, podatek i ZUS – jeżeli dotyczy
  • Wynagrodzenie członka zarządu z powołania od 50 zł/os./mies. naliczenie wynagrodzenia i rozliczeń
  • Dodatkowa umowa lub aneks od 50 zł przygotowanie dokumentu
  • Korekty poprzednich okresów wycena indywidualna zakres ustalany po analizie dokumentów

Obsługę zatrudnienia można dołączyć do wybranego pakietu księgowego. W ramach pełnej obsługi kadrowo-płacowej przygotowujemy m.in. listy płac i rachunki, zgłoszenia i wyrejestrowania ZUS, deklaracje ZUS, dokumentację pracowniczą oraz PIT-11.

Usługi dodatkowe

  • Założenie JDG przy stałej obsłudze bezpłatnie
  • Założenie JDG bez dalszej obsługi od 250 zł
  • Pomoc przy założeniu spółki z o.o. od 699 zł
  • Rejestracja do VAT od 250 zł
  • Roczny PIT przedsiębiorcy poza pakietem od 250 zł
  • Sprawozdanie finansowe i roczny CIT wycena indywidualna
  • Przejęcie księgowości w trakcie roku wycena indywidualna
  • Wyprowadzenie zaległości i korekty wycena indywidualna
  • Raporty i zestawienia do banku wycena indywidualna

Opisz krótko swoją działalność – odeślemy konkretną kwotę i zakres obsługi w ciągu jednego dnia roboczego.

Ważne informacje

  • Ostateczna cena zależy m.in. od liczby operacji bankowych, statusu VAT, transakcji zagranicznych, zatrudnienia, liczby rachunków, leasingów i środków trwałych.
  • Za dokument uznajemy m.in. fakturę zakupu lub sprzedaży, raport fiskalny, listę płac, dokument wewnętrzny albo inny dokument wymagający zaksięgowania.
  • Cennik ma charakter informacyjny i nie stanowi oferty w rozumieniu art. 66 § 1 Kodeksu cywilnego. Do podanych cen należy doliczyć 23% VAT.

Zakres usług

Co obejmuje obsługa księgowa lekarzy i placówek medycznych?

Zakres obsługi dopasowujemy do formy działalności i wybranego pakietu. W ramach naszych usług księgowych dla lekarzy i placówek medycznych z umowami z NFZ oferujemy m.in.:

Prowadzenie KPiR, ewidencji ryczałtu lub pełnych ksiąg rachunkowych

Porównanie form opodatkowania: ryczałt 14%, podatek liniowy, skala

Faktury dla szpitali i przychodni wystawiane w KSeF

Rozliczenie sprzedaży z kasy fiskalnej online w gabinecie

Kwalifikacja usług do zwolnienia z VAT i proporcja odliczenia

ZUS i składka zdrowotna przy kilku tytułach do ubezpieczeń

Rozliczenia przychodni z NFZ i kontrola wpływów za świadczenia

Kontrakty lekarzy, pielęgniarek i personelu medycznego

Rozliczenie etatu, kontraktu i praktyki w zeznaniach rocznych

Kadry i płace personelu: etat, umowy zlecenia, dyżury medyczne

Reprezentacja przed US i ZUS oraz wsparcie przy kontroli NFZ

Miesięczna analiza przychodów z kontraktów, gabinetu i NFZ

Dokładny zakres usług zawartych w miesięcznej cenie zależy od wybranego pakietu.

Lekarz w białym fartuchu wypełnia dokumenty przy biurku w gabinecie

Specyfika branży

Znamy pułapki księgowe branży medycznej

Cztery rzeczy, na których najczęściej potykają się biura rachunkowe bez doświadczenia w obsłudze lekarzy:

Składka zdrowotna zależy od formy opodatkowania

Na ryczałcie płacisz stałą kwotę zależną od progu rocznych przychodów, na podatku liniowym – procent od dochodu. Porównując formy opodatkowania, liczymy podatek i składkę razem.

Wpis do RPWDL przed pierwszym pacjentem

Praktyka lekarska – także ta wykonywana wyłącznie na kontrakcie w szpitalu – wymaga wpisu do rejestru podmiotów wykonujących działalność leczniczą i obowiązkowego OC. Zakładając JDG lekarza, przypominamy o każdym z tych kroków.

Etat i kontrakt to dwa tytuły do ZUS

Gdy etat daje co najmniej minimalne wynagrodzenie, składki społeczne z działalności są dobrowolne, ale składkę zdrowotną płacisz z każdego tytułu. Gdy pensja spadnie poniżej minimalnej, składki społeczne z działalności stają się obowiązkowe i wówczas należy zmienić zgłoszenie.

Kilka umów, różne dokumenty

Szpital chce faktury w KSeF, pacjent – paragonu, a uczelnia płaci za wykłady na podstawie umowy cywilnoprawnej. Każdy z tych przychodów przypisujemy do właściwego źródła i wykazujemy w odpowiednim zeznaniu.

Proces

Jak wygląda współpraca?

Trzy kroki od pierwszej rozmowy do przejęcia księgowości lekarza lub placówki medycznej – bez przestoju w rozliczeniach i bez ryzyka dla terminów podatkowych.

Mężczyzna w garniturze omawia dokumenty z lekarzami przy stole
1

Bezpłatna konsultacja i analiza

15 minut rozmowy o kontraktach, praktyce prywatnej, etacie i formie opodatkowania. Bez zobowiązań.

2

Oferta dopasowana do modelu pracy

Stała cena miesięczna z wypisanym zakresem – inna dla lekarza z jednym kontraktem, inna dla przychodni, która ma umowę z NFZ i własny zespół. Umowę podpiszesz elektronicznie.

3

Przejęcie dokumentacji i start współpracy

Odbieramy dokumenty od poprzedniego biura, weryfikujemy poprawność przekazanych danych i ciągłość rozliczeń, po czym zgłaszamy pełnomocnictwa do US i ZUS. Ty w tym czasie przyjmujesz pacjentów.

FAQ – księgowość dla lekarzy

Najczęstsze pytania lekarzy i placówek medycznych

Nie ma tu Twojego pytania? Napisz – odpowiadamy w ciągu jednego dnia roboczego.

Ile kosztuje księgowość dla lekarza?

Cena zależy od liczby dokumentów, formy prawnej i tego, czy oprócz kontraktu przyjmujesz pacjentów prywatnych. Widełki znajdziesz w cenniku, a konkretną kwotę odsyłamy po 15-minutowej rozmowie o Twojej praktyce.

Jaka jest stawka ryczałtu dla lekarzy w 2026 roku?

Usługi w zakresie opieki zdrowotnej rozlicza się ryczałtem 14% od przychodu – dotyczy to lekarzy i lekarzy stomatologów, a także m.in. pielęgniarek, położnych i fizjoterapeutów. Przychody z innych usług, np. szkoleń, mogą podlegać innej stawce, dlatego wykazujemy je w ewidencji osobno.

Co się bardziej opłaca lekarzowi – ryczałt czy podatek liniowy?

Przy niskich kosztach, typowych dla kontraktu w szpitalu, ryczałt 14% często wychodzi korzystniej – brak odliczenia kosztów niewiele wtedy zmienia, a stawka jest niższa. Podatek liniowy zaczyna się opłacać, gdy koszty są wysokie, np. przy własnym gabinecie i sprzęcie. Obie formy porównujemy na Twoich liczbach, razem ze składką zdrowotną.

Kiedy lekarz może być na ryczałcie, a kiedy nie?

Większość lekarzy prowadzących JDG może wybrać ryczałt. Nie skorzystasz z niego m.in. wtedy, gdy na kontrakcie robisz dla obecnego lub byłego pracodawcy to samo, co w tym albo w poprzednim roku w ramach etatu. Wybór ryczałtu zgłaszasz do 20. dnia miesiąca następującego po miesiącu, w którym pojawił się pierwszy przychód w roku.

Czy lekarz potrzebuje kasy fiskalnej?

Tak, jeśli przyjmuje pacjentów prywatnych – lekarze i lekarze dentyści ewidencjonują sprzedaż na kasie online od pierwszej wizyty, bez limitu zwolnienia. Kasa nie jest potrzebna lekarzowi, który pracuje wyłącznie na kontrakcie i wystawia faktury szpitalowi lub przychodni.

Czy usługi medyczne są zwolnione z VAT?

Są zwolnione, jeśli służą profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu lub poprawie zdrowia. Zwolnienie nie obejmuje m.in. zabiegów medycyny estetycznej bez wskazań zdrowotnych i części zaświadczeń wydawanych np. na potrzeby ubezpieczycieli. Przy sprzedaży mieszanej ustalamy proporcję odliczenia VAT.

Lekarz na ryczałcie a KSeF – kiedy faktury trafiają do systemu?

Forma opodatkowania nie ma tu znaczenia. Jeśli wystawiasz faktury szpitalowi lub przychodni, trafiają one do KSeF bez względu na to, czy usługa jest zwolniona z VAT. Faktur dla pacjentów prywatnych nie trzeba wysyłać do systemu. Podłączamy Cię do KSeF i sprawdzamy, czy żadna faktura dla firmy nie została pominięta.

Pracuję na etacie i na kontrakcie – jak płacę składki?

Jeśli z etatu masz co najmniej minimalne wynagrodzenie, z działalności obowiązkowo płacisz tylko składkę zdrowotną, a składki społeczne możesz opłacać dobrowolnie. Przy ryczałcie i podatku liniowym przychody z etatu i z kontraktu rozliczasz w osobnych zeznaniach.

Obsługujecie lekarzy spoza Krakowa?

Tak. Jako biuro rachunkowe dla lekarzy i praktyk medycznych pracujemy zdalnie z klientami z całej Polski – dokumenty przekazujesz elektronicznie, a kontakt z księgowym prowadzisz mailowo, telefonicznie lub na wideorozmowie.

Czy pomożecie przejść z obecnego biura rachunkowego?

Tak. Przejmujemy dokumentację, weryfikujemy otwarcie ksiąg, ustalamy stan rozliczeń z US i ZUS oraz przygotowujemy pełnomocnictwa. Cały proces zwykle zamyka się w jednym miesiącu i nie wymaga przerwy w rozliczeniach.

Skup się na pacjentach, nie na podatkach

Pierwsza konsultacja jest bezpłatna i trwa 15 minut. Odpowiemy w ciągu jednego dnia roboczego.

Opinie w Google

Co mówią o nas klienci

  • Polecam usługi. Zawsze wszystko dopilnowane i na czas. Polecam, jeśli ktoś szuka księgowości w przystępnej cenie i bardzo dobrej jakości obsługi.

    Jakub Czmielewski
  • Bardzo dobra współpraca. Profesjonalna obsługa, sprawny kontakt i szybkie odpowiedzi na pytania. Wszystko załatwiane terminowo i bez zbędnych komplikacji. Polecam.

    Artur Góra
  • Jestem bardzo zadowolony. Miła obsługa, szybki kontakt i w końcu mam porządek w papierach!

    Paweł Malec
  • Jestem bardzo zadowolona ze współpracy z p. Natalią i biurem rachunkowym AGMER 😊 Wszystko odbywa się na najwyższym poziomie z dużym zaangażowaniem, a także ogromną życzliwością i zrozumieniem, POLECAM

    Kasia
  • Jestem zadowolona ze współpracy. Fachowa pomoc, szybka komunikacja i rzetelna obsługa.
    Zdecydowanie polecam.

    Magdalena

Źródło opinii: Google Maps

Umów się na bezpłatną konsultację